南軒書院以張浚張栻墓為依托，以傳統書院建筑結構為基本格調，整體為封閉的四合院結構，體現濃郁的書院文化氛圍。

南軒書院院落中軸為張浚祠堂和張栻祠堂，祠堂陳列張浚張栻父子半身塑像，后面為享堂，書院內設有文化陳展室、講堂、會議廳、藏書閣等，歷史底蘊濃厚，人文環境優美。陳展室由岳麓書院設立，以張浚張栻生平為主線，集中展現了南軒思想的產生、發展、成熟及對后世的影響等。

南軒書院背靠羅帶山，面朝溈水，綠水青山相間，宛如為一幅美輪美奐的水墨畫。